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これは日々の作業を通して学んだことや毎日の生活で気づいたことをを記録しておく備忘録である。
HTML ファイル生成日時: 2024/11/21 17:40:55.112 (台灣標準時)
pkgsrc の math/py-numexpr
pkgsrc で math/py-numpy が最新の 1.23.2 に更新されていたでござる。いつ
のも悪い癖で、最新のバージョンに入れ替えようと思ってしまったでござる。
math/py-numpy に依存している Python パッケージは多いので、
math/py-numpy を入れ替えようとすると、インストール済みの多くの Python
パッケージを一度削除する必要が生じるでござる。 scipy や matplotlib や
astropy などを削除して、 py-numpy-1.23.2 をインストールしてみたでござ
る。その後、 scipy や matplotlib や astropy などをインストールし始めた
のでござるが、 math/py-numexpr のコンパイルでエラーが生じたでござる。
以下のようなメッセージが表示されたでござる。
gcc -Wno-unused-result -Wsign-compare -DNDEBUG -O2 -fPIC -D_FORTIFY_SOURCE=2 -I/usr/include -I/usr/pkg/include -O2 -fPIC -D_FORTIFY_SOURCE=2 -I/usr/include -I/usr/pkg/include -O2 -fPIC -D_FORTIFY_SOURCE=2 -I/usr/include -I/usr/pkg/include -O2 -fPIC -D_FORTIFY_SOURCE=2 -I/usr/include -I/usr/pkg/include/python3.9 -I/usr/pkg/include -I/usr/pkg/include/netlib -I/usr/include -I/usr/pkg/include/python3.9 -I/usr/pkg/include -fPIC -I/usr/pkg/lib/python3.9/site-packages/numpy/core/include -Iframestream -I/usr/pkg/include/python3.9 -c numexpr/interpreter.cpp -o build/temp.netbsd-9.99.99-amd64-cpython-39/numexpr/interpreter.o
numexpr/interpreter.cpp: In function 'PyObject* NumExpr_run(NumExprObject*, PyObject*, PyObject*)':
numexpr/interpreter.cpp:1272:59: error: 'NPY_ARRAY_UPDATEIFCOPY' was not declared in this scope; did you mean 'NPY_ITER_UPDATEIFCOPY'?
1272 | NPY_ARRAY_ALIGNED|NPY_ARRAY_UPDATEIFCOPY);
| ^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
| NPY_ITER_UPDATEIFCOPY
error: command '/usr/pkgsrc/math/py-numexpr/work/.cwrapper/bin/gcc' failed with exit code 1
*** Error code 1
Stop.
make[1]: stopped in /usr/pkgsrc/math/py-numexpr
*** Error code 1
Stop.
make: stopped in /usr/pkgsrc/math/py-numexpr
調べてみると、同じ問題が報告されていたでござる。
pkgvi を使って、 math/py-numexpr の
work/numexpr-2.8.1/numexpr/interpreter.cpp というファイルを編集し、
mkpatches; make mps を実行してみたら、 make clean; make install でイン
ストールができるようになったでござる。
patch は以下の通りでござる。
$NetBSD$
--- numexpr/interpreter.cpp.orig 2018-07-12 17:49:43.000000000 +0000
+++ numexpr/interpreter.cpp
@@ -1269,7 +1269,7 @@ NumExpr_run(NumExprObject *self, PyObjec
}
Py_INCREF(dtypes[0]);
a = (PyArrayObject *)PyArray_FromArray(operands[0], dtypes[0],
- NPY_ARRAY_ALIGNED|NPY_ARRAY_UPDATEIFCOPY);
+ NPY_ARRAY_ALIGNED);
if (a == NULL) {
goto fail;
}
- About this article:
- author: daisuke
- file: 20220908_0.html
- category: Computer___NetBSD
- title: pkgsrc の math/py-numexpr
- mode: public
- last modified: 2022/09/08 17:42:59 (Taiwan Standard Time)
- html generated: 2024/11/21 17:40:55.112 (Taiwan Standard Time)
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