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これは日々の作業を通して学んだことや毎日の生活で気づいたことをを記録しておく備忘録である。

HTML ファイル生成日時: 2024/12/21 11:44:57.596 (台灣標準時)

pkgsrc の math/py-numexpr

pkgsrc で math/py-numpy が最新の 1.23.2 に更新されていたでござる。いつ のも悪い癖で、最新のバージョンに入れ替えようと思ってしまったでござる。 math/py-numpy に依存している Python パッケージは多いので、 math/py-numpy を入れ替えようとすると、インストール済みの多くの Python パッケージを一度削除する必要が生じるでござる。 scipy や matplotlib や astropy などを削除して、 py-numpy-1.23.2 をインストールしてみたでござ る。その後、 scipy や matplotlib や astropy などをインストールし始めた のでござるが、 math/py-numexpr のコンパイルでエラーが生じたでござる。 以下のようなメッセージが表示されたでござる。 


gcc -Wno-unused-result -Wsign-compare -DNDEBUG -O2 -fPIC -D_FORTIFY_SOURCE=2 -I/usr/include -I/usr/pkg/include -O2 -fPIC -D_FORTIFY_SOURCE=2 -I/usr/include -I/usr/pkg/include -O2 -fPIC -D_FORTIFY_SOURCE=2 -I/usr/include -I/usr/pkg/include -O2 -fPIC -D_FORTIFY_SOURCE=2 -I/usr/include -I/usr/pkg/include/python3.9 -I/usr/pkg/include -I/usr/pkg/include/netlib -I/usr/include -I/usr/pkg/include/python3.9 -I/usr/pkg/include -fPIC -I/usr/pkg/lib/python3.9/site-packages/numpy/core/include -Iframestream -I/usr/pkg/include/python3.9 -c numexpr/interpreter.cpp -o build/temp.netbsd-9.99.99-amd64-cpython-39/numexpr/interpreter.o
numexpr/interpreter.cpp: In function 'PyObject* NumExpr_run(NumExprObject*, PyObject*, PyObject*)':
numexpr/interpreter.cpp:1272:59: error: 'NPY_ARRAY_UPDATEIFCOPY' was not declared in this scope; did you mean 'NPY_ITER_UPDATEIFCOPY'?
 1272 |                                         NPY_ARRAY_ALIGNED|NPY_ARRAY_UPDATEIFCOPY);
      |                                                           ^~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
      |                                                           NPY_ITER_UPDATEIFCOPY
error: command '/usr/pkgsrc/math/py-numexpr/work/.cwrapper/bin/gcc' failed with exit code 1
*** Error code 1

Stop.
make[1]: stopped in /usr/pkgsrc/math/py-numexpr
*** Error code 1

Stop.
make: stopped in /usr/pkgsrc/math/py-numexpr

調べてみると、同じ問題が報告されていたでござる。

pkgvi を使って、 math/py-numexpr の work/numexpr-2.8.1/numexpr/interpreter.cpp というファイルを編集し、 mkpatches; make mps を実行してみたら、 make clean; make install でイン ストールができるようになったでござる。

patch は以下の通りでござる。 


$NetBSD$

--- numexpr/interpreter.cpp.orig	2018-07-12 17:49:43.000000000 +0000
+++ numexpr/interpreter.cpp
@@ -1269,7 +1269,7 @@ NumExpr_run(NumExprObject *self, PyObjec
             }
             Py_INCREF(dtypes[0]);
             a = (PyArrayObject *)PyArray_FromArray(operands[0], dtypes[0],
-                                        NPY_ARRAY_ALIGNED|NPY_ARRAY_UPDATEIFCOPY);
+                                        NPY_ARRAY_ALIGNED);
             if (a == NULL) {
                 goto fail;
             }

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